Для лечебных целей используют плоды помидора, которые заготавливают по мере созревания, и их сок. Установлено, что свежий томатный сок подавляет рост некоторых бактерий и болезнетворных грибков, понижает кровяное давление и уровень холестерина в крови, а водный экстракт из листьев усиливает тонус и перистальтику гладкой мускулатуры.
Свежий томатный сок обладает противовоспалительным действием. Его применяют при язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки, колитах, холецистите. Разрезанные плоды прикладывают к абсцессам, используют для лечения длительно незаживающих ран и язв. Имеются данные, что плоды стимулируют функцию желез внутренней секреции (в том числе половых) и повышают сопротивляемость организма неблагоприятным факторам внешней среды. Поэтому томаты следует употреблять людям, работающим с источниками радиоактивного излучения и проживающим на загрязненных радионуклидами территориях.